ヨーグルパックを購入して使っていたのですが、キャップ（牛乳パックの蓋）をなくしてしまいました。ラップなどをしてヨーグルトは作れるのですが、菌は死んでしまわないでしょうか？

返答が大幅に遅れ申しえあけありません。
ラップをすれば雑菌は侵入しませんので問題はありません。
出来たヨーグルトは、乳酸菌群が優勢となっていますので、
菌の死滅は起きません。

ただ、嫌気性の菌群が多いので、4日以内を目安に摂取してください。